Kompetisi CRYSTAL pada edisi kali ini memfokuskan pada hal-hal yang berkaitan tentang aplikasi ilmu kimia dalam penanganan permasalahan lingkungan. Pengaplikasian ilmu kimia dalam penanganan permasalahan lingkungan dapat mencakup berbagai hal. Mulai dari penanganan limbah tambang, hingga proses sintesis hijau obat-obatan. Pemecahan masalah dari proses aplikasi kimia di lingkungan ini yang akan menjadi tantangan bagi para peserta CRYSTAL 2025.

Dalam proses berjalannya kompetisi CRYSTAL 2025, peserta akan diseleksi pada empat babak yaitu penyisihan, perempat final, semifinal, dan final. Pada babak penyisihan, para peserta harus mengerjakan sebanyak 60 soal dalam waktu 120 menit secara daring. Pada babak ini akan diseleksi sebanyak total 30 tim yang memperoleh poin tertinggi untuk melaju ke babak selanjutnya. Setelah itu, tim yang lolos akan melanjutkan ke babak perempat final yang dilaksanakan secara luring di Kampus Ganesha ITB pada hari Sabtu, 21 Februari 2024. Pada babak perempat final ini, peserta mengerjakan sepuluh soal dari lima kelompok keilmuan yang berbeda selama 120 menit. Kemudian 15 tim dengan nilai tertinggi akan lolos ke babak semifinal yang dilakukan keesokan harinya pada hari Minggu, 22 Februari 2025. Babak semifinal berlangsung selama 90 menit dengan masing-masing tim mengerjakan 25 soal. 5 tim yang memperoleh nilai terbaik pada babak semifinal dapat melanjutkan ke babak final. Babak final, kelima tim akan bersaing pada praktikum dan babak cerdas cermat untuk memperebutkan juara.